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《环球时报》独创了通栏大标题，即一个主题贯穿头版，用超大号的黑体字，标题字数在7到9个字。下面附以彩色字体的小肩题，然后是大幅彩色新闻图片，引题则用红、蓝、绿等颜色来印刷，头版头条只放一篇长文，而同一期的《参考消息》头版最少三篇小消息。这个版式令《环球时报》在报摊上容易引起注意。
业务流程上，《环球时报》亦有独到之处。它建立了一套盯新闻制度，把世界上所有国际和地区按区域划分，每个编辑记者各负责一个区，每天报告该地区的重大新闻，除此之外，还列出一个国内和国外主要媒体的清单，每天有人负责盯住这些媒体，所有员工都要参与，轮流值班，遇到重大新闻随时报，即使整日风平浪静，也必须在下班前报出一个有效选题。这使得《环球时报》几乎不会漏掉任何重要新闻，并能随时作出反应。
911事件被《环球时报》内部视作快速反应能力的经典案例。当时编辑部员工分A、B组轮流休假，A组到张家界度假，B组留守。在驻美记者打回电话的两个小时之内，留守的编辑部成员会全部赶到办公室，连夜做出特刊，第二天早上见报，此时A组员工也飞回北京，接替B组连续做追踪和深度报道。
《环球时报》拥有强大的发行网，它在全国有46个分印点，9个发行站，每次报纸头版一确认，会立即告知发行站，确保早上8点报摊上可以买到报纸。《环球时报》在发行上几乎实现了100%的回款，长年保持账户大量的现金流。
《环球时报》员工平均年龄只有30出头，员工教育背景各异，大都以国际关系、外交、新闻、外语专业为主。这些年轻人不仅承担高强度工作，也要遵守严格的规章和纪律。《环球时报》不定期开设考试，内容多有关时事政治、新闻写作等，编辑部参加考试，成绩计入考核。聘用专家作为评报员，对每一期报纸挑错并点评，被挑出错误的编辑将被罚款。
《环球时报》另有一不成文规矩——凡是与人说话，都要站起来说。一次有人到编辑部访友，一进门，所有人全部起立、来客吃惊地立在当地不知如何是好。《人民日报》有高层到《环球时报》视察，眼见全体起立的场景，对何崇元管理之能印象深刻。
它有极为严苛的上班纪律。每个员工迟到次数都会留下记录，早上9点上班，全年迟到超过10次降为试用期，所有员工必须24小时开通手机，和编辑部失去联络会面临重罚，甚至开除。
虽然要求苛刻，工作压力极大，《环球时报》还是不乏吸引力，2000年前后，《环球时报》编辑的年薪10万左右，中层或者骨干员工达到15万至20万，在当时处于媒体的高薪阶层，这种激励制度确实网罗到了大批人才，后来很多人出走后成为行业精英。
今天看，中国找不到第二家报纸外观像《环球时报》一样俗艳土气：封面左上方时红底白字的报头，它与右侧竖排蓝底白字或绿底白字的二条新闻标题区，构成最不和谐的颜色搭配，而红色报头右边土黄色底子的小方块，永远是药品广告。在中国各地都市报纷纷学习西方媒体版式设计的今天，只有《环球时报》依然坚持上世界中国报纸凌乱的审美风格。
虽然《环球时报》的风格为同行诟病，但它却逼得《参考消息》不得不学习《环球时报》：版式上，增大头条新闻标题在版面上的宽度，在右侧放置黑底白字的二条新闻标题，标题的语言风格上，由过去的端庄平稳向火爆直白靠拢。
《环球时报》“土”得自有其道理——何崇元有个理论：一张报纸放在报摊上，路人从看标题到决定买的时间只有0.8秒，要在这个时间里影响读者，通栏标题要特别简练，要求字数是7-9个字，8个字正合适。