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接下去，科学家们又讨论遗体隔氧问题。为防止遗体腐烂，气相保存部份必须隔绝氧气。把氧气从水晶棺中100％地排除是不可能的，通常最高能达到99.99％。但为了长久保存毛主席遗体，专家们硬是制定了更高的标准。这项工程主要由清华大学负责。
专家们紧接著讨论气相保存该用哪种惰性气体。一开始大家提到氮气，从惰性程度和相关指标来看，氮气是理想的。可是一位专家却提出用氦气。氦气的惰性比氮气更强，这当然好，可价格却高得惊人，一般情况下无人敢问津。但既然有人提出用氦气，就没有人再敢坚持用氮气。为了保护毛的遗体，钱是不能作为考虑因素的，一切都必须用最好的。
毛的遗体不仅不能腐烂，还要能供瞻仰，因此要特别注意毛的遗容和神态。毛的脸部不能化妆，因为任何化妆品都会损害皮肤，只能将柔和略带红色的光照射到面部。有的专家主张颜色要鲜艳一些，显得毛很健康。可有的专家提出异议，说人已去世了，弄得太红与事实不符。经过反覆讨论，才定下一种比较满意的颜色。
毛主席遗体每天每时都在发生变化，科学家的任务就是要把变化减到最小最慢。因此，要经常对毛的遗体进行多方面的监测。不过，有的指标是很难监测的，例如面部的肤色，是深了还是浅了？深了多少浅了多少？这即使使用现代科技也难以定量。科学家们绞尽脑汁，决定采用「邮票法」。
他们找来「邮票法」标准颜色簿，上面有各种各样的颜色，每种颜色又由浅到深逐渐递进，相互间差别很细微。工作人员用这个颜色簿来核对毛的肤色，看同哪个颜色最接近。一个月後看看有什么变化；三个月後再看看有什么变化，依此类推。尽管这是个原始的办法，要*肉眼来判断，但也没有比这更行之有效的办法了。
纪念堂里的毛主席遗体
1977年8月20日，位於天安门广场的纪念堂完工，毛的遗体及几罐浸泡在福尔马林里的内脏，被转运到纪念堂内。经过适应性处理後，遗体被移入水晶棺内。
毛的遗体保存在纪念堂地下室一间无菌、无尘、恒温的密室内。盛放毛主席遗体的水晶棺其实是一个水晶罩。当毛的遗体供瞻仰时，就用电动升降机将其从地下室升上来。遗体在水晶棺内采取气液相结合的保存方法，毛遗体的衣服里包著液体，只有面部处於气态环境中。瞻仰结束後，遗体降到地下室一个密闭的容器内。毛的颈部插了一根管子，以便向毛的遗体灌注福尔马林液。
每年毛的生日即12月26日後，毛的遗体都要停止瞻仰一段时间，作年度性的保护。这段期间，工作人员把毛的头部和双手也浸到液体中去，以补足水份。
人们大都以为纪念堂里只供奉著毛的遗体，殊不知还有另一位男性死者陪著毛。这位死者姓甚名谁无关紧要，重要的是他的年龄、体重、体型及死因，都同毛相近。除了不供人瞻仰，这位死者享受著与毛几乎一样的待遇。这位死者在生前，做梦也不会想到有幸为毛伴驾。凡是准备在毛遗体上施用的保存技术，都要先在这位伴驾身上施用，成功了再用於毛身上。每隔一段时间，就从毛和伴驾身上分别取下若干小颗粒，送到相关研究机构去，检查遗体组织结构的保存情况。
负责检验的科学家只知道小颗粒的编号，却不知道哪些取自毛身上，哪些取自伴驾身上。检验结果送给另一批科学家，由他们来解读，决定下一步的保存措施。
和毛主席遗体同在地下室的，除了那位伴驾，还有一具毛的蜡像。中国共**政治局决定永久保存毛主席遗体後，时任政治局常委的叶剑英，就指示北京工艺美术学院「制作一个毛主席的蜡像，要做得完全和真的一样，等以後必要的时候可以代用。」为此，两位研究员专程前往英国蜡像馆，学习蜡像制作。後来，他们的水平大大超过英国，制作的毛蜡像栩栩如生，看上去活像毛泽东本人。