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肝硬变合并症在临床中较为常见，且表现的症状多样，随着肝硬变肝功能失代偿的出现，可发生不同的合并症。最常见的合并症有以下几种：
1上消化道大出血
肝硬变发展到肝功能失代偿的后期；由于肝细胞不断坏死、增生，结缔组织及瘢痕形成，肝小叶结构异常改变，致使门静脉压力进一步升高。日久天长，在曲张静脉部位的食管或胃的粘膜变薄，加上食物的机械刺激损伤，胆汁胃液反流的化学腐蚀，腹水以及恶心、呕吐、便秘、咳嗽、呃逆时腹压的增加，均可使门静脉的压力突然升高，导致曲张的静脉破裂出血，形成上消化道大出血。
2腹水及浮肿的形成
由于肝硬变后期门静脉压力升高，致门静脉系毛细血管内压增高，同时又因压力升高后血管壁变薄，通透性增加，原来不能透过的水分、部分蛋白质及电解质渗入腹腔。肝硬变时由于肝功能失代偿时蛋白质的消化吸收障碍和肝脏加工合成白蛋白的功能减退，致使血中白蛋白减少，血浆胶体渗透压降低，血浆内大量的水分渗入腹腔，形成腹水。
3原发性腹膜炎及合并其它部位感染
肝硬变时由于病人身体抵抗力降低，易并发各种感染，如细菌性肺炎、支气管炎、尿路炎、肠炎、结核性腹膜炎及肺结核等。
4肝昏迷
肝功能严重衰竭时可发生肝昏迷。正常情况下，肝脏对蛋白质氨基酸的代谢是：蛋白质→氨基酸→去氨作用→氨→尿素。肝硬变后期，由于肝功能严重障碍，去氨作用差，氨不能进一步合成尿素，血液中氨的浓度升高，毒害中枢神经系统。
患者起初躁动不安、谵妄、痉挛，后期嗜睡、昏迷。同时由于肝细胞的缺氧、缺血、坏死，以及细胞组织的无氧代谢产生大量的有毒物质也毒害中枢神经系统，从而进一步加重了肝昏迷。
5原发性肝癌
原发性肝癌的病因是多方面的、综合性的因素。目前认为与饮用水的污染、黄曲霉菌、亚硝胺、农药、肝脏寄生虫感染，以及营养不良等有密切关系。
在我国还与病毒性肝炎关系十分密切。通过调查，肝硬变由肝炎病毒引起的多系结节性肝硬变，而结节性肝硬变发展成肝癌的比例高。
6门静脉血栓形成
约有10%一15%的肝硬变患者可并发门静脉血拴形成。其原因主要与门静脉梗阻造成门静脉血流缓慢，以及门静脉内膜炎、硬化有关。如肝硬变病人突然出现剧烈腹痛、腹胀、呕吐、便血、休克等表现，则应考虑门静脉血栓形成。