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差别大的在于医疗。副部级的医疗证封皮是蓝色的，正部级是绿色的。凭医疗证去看病，不用排队挂号，住院也可以享受单间病房。二者的报销程序也不一样，正部级的费用直接由卫生部门与医院结算，副部级的费用则要到原单位报销。
在媒体报道中，经常会出现 “部长级待遇”、“副部长级待遇”等字眼。这意味着，有些人可能级别达不到部级，但可以享受部级的待遇。提高享受待遇是离退休干部政策之一，可以是综合待遇，也可以是单项待遇如政治待遇、生活待遇、医疗待遇中的一项。
1984年，中央就在全国范围内将一些稍低级别的干部提高为享受(副)部级待遇，或(副)部级医疗待遇。2011年，建党90周年之际，中央又提高了一些老干部的医疗待遇。
根据中央有关部门的通知，1937年7月6日前参加革命工作、离休前为正、副厅局级的离休干部，可以提高享受省(部)长级医疗待遇。1937年7月7日至1938年12月31日参加革命工作、离休前为副厅局级的离休干部，可以提高享受副省(部)长级医疗待遇。1937年7月7日至1942年12月31日参加革命工作、“文化大革命”前为副厅局级的离休干部，提高享受副省(部)长级医疗待遇。
在云南，省内全部37名老红军现在也都享受副部级以上医疗待遇。不仅是老干部，在职人员中，“享受待遇”也很常见。众所周知，两院院士就可以享受副部级干部的乘车和医疗待遇。
事业单位中，教育部已有31所直属高校校长明确为副部级干部，但学校的级别没有提升，国家图书馆馆长、故宫博物院院长都是副部级干部。一些团体的领导如红十字会常务副会长都是副部级干部。此外，一些国有企业的领导也是副部级干部。
大体上，级别对于单位而言，领导有了机会看高级别的文件，对领导个人而言，最大的好处是医疗待遇。