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部级机构另一集中系统是在党的中央部门，除中纪委与国务院下属的监察部合署外，中组部、中宣部、中编办等15个中央部门都是正部级机构，人民日报、中央党校、文献研究室、党史研究室等4个事业单位也是正部级机构。
上述这些部门的领导都是正部级干部，但有些重要部门如：中组部、中宣部、中央党校、中央政法委等部门，通常由正部级干部担任常务副职。
中央驻香港、澳门联络办主任、最高人民法院常务副院长、最高人民检察院常务副检察长也是正部级干部。
中国还有19个地位特殊的社会团体。共青团、妇联、文联、作协、残联、科协、全国侨联等10个左右的机构主要领导都是正部级干部。
中国还有一个特殊的现象，八大民主党派中央主席一般都是担任全国人大常委会和全国政协的领导职务，但副职和常务副职也有正部级干部。
保守估算，“中央部门”的部级干部(不含全国人大和全国政协)应该超过100人。
此外，全国人大、全国政协还集中了一批从党政机构卸任的正部级干部，具体集中在各专门委员和工作委员，全国人大有9个专门委员会，5个工作和办事机构，全国政协也有9个专门委员会，1个办事机构。
地方上31个省（市、自治区），基本每个省（市、自治区）有3名正部级干部，分别是书记兼人大常委会主任、省长、政协主席，地方上大约有95名以上正省部级干部。
“部”与“副部”的升降逻辑
正部级机构和副部级机构的差别在哪里呢？
以国务院下属的机构为例，正部级单位的公章直径是5厘米，副部级的是4.5厘米，这个国务院规定，是正部级单位和副部级的一个精准的量化差别，也是一般人难以觉察的差别。在国务院所属机构中，叫部、委、总局、总署都是正部级，叫“局”的一般都是副部级，如国家文物局、国家林业局、国家信访局等。一般正部级机构内设的处理日常综合事务的部门大多数叫“办公厅”，而副部级单位如国家旅游局等大多叫“办公室”。
2001年，国务院为了“加强适应市场经济要求、适应加入世贸组织要求”，将新闻出版署升格为总署，国家工商局升格为总局，技监局、出入境检疫合并升格成质检总局，都由副部级单位成了正部级单位。
2005年1月国家安监局被升格为安监总局，由副部升为正部。
退休之后有差别
在泱泱中国，官至部级，成为名副其实的高层领导，当然可以名正言顺地享有专车。按规定，正省部长级干部配备价格在45万元以内的小轿车；副部长级的标准在35万以内，排气量都在3.0升及以下。
正部级干部与副部级干部的办公室大小也不一样。2009年规定，部级干部的办公室面积不能超过54平方米，副部级的不超过42平方米。
在住房方面， 2001年公开颁布的《在京中央和国家机关部级干部住房制度改革实施意见》规定，正部级干部购房补贴建筑面积标准为220平方米，副部级190平方米。
部长和副部长的待遇，在任时差别并不大，不过退休后会有明显差别。
现在仍在世的正部级离退休高干有3700余人，离退休的副部级高级干部有2.7万余人。
根据有关部门关于离退休干部工作机制设置的通知规定，老干部局(处)的工作人员包括管理人员、医护人员、司机等，在人员配备上，老干部局的工作人员与退休干部的比例是1∶30，但对离退休的正副部级干部则是按1：1配备人员。
但正副部长之间的退休待遇是有差别的，退休后部级干部可以有专车，副部级就没有了，但也会保证用车。部长退休了还有专职秘书，副部长不会再配秘书。一些刚退下来的副部级有的还配备有秘书，过不了几年就没有秘书了。