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而在整个过程中，代孕妈妈的心理生理也难以避免被伤害。
由于代孕本身牵涉到的宗教、道德、伦理、法律等问题，会对她的心理形成巨大压力，而这种压力无疑会伴随其终身，成为其难以泯灭的噩梦。
另外，由于代孕妇女并不是自身怀孕，体内激素等内环境与正常怀孕不同，故常需通过人工注射激素等维持胎儿的生长，如黄体酮、孕激素等，但即使如此，出现流产、早产的风险还是比正常孕妇要大得多。因此，对于代孕妈妈来说，代孕的最大健康风险，就是流产的并发症。
而流产的并发症有大出血、感染、子宫复旧不佳、急性肾功能衰竭以及胎盘息肉等。而流产对子宫本身来说，伤害很大，严重者可发生感染性休克危及生命，恢复后也可能会引起终身不孕。
此外，代孕妈妈十月怀胎一朝分娩，若“代孕子”健康活泼，自然皆大欢喜；但天有不测风云，如果孩子身体欠佳，或者委托方对孩子不满意，又会出现什么情况呢？类似的事情，早在1983年的美国就发生过。
马勒可夫夫妇委托史迪华太太为他们生一个孩子，为此承诺支付一万美元。但孩子出生后就被发现身患重病，还有失明、失聪及弱智的可能性。于是，双方都不想要这个孩子，为此还打起了官司。结果是两败俱伤，马勒可夫夫妇离异；史迪华夫妇没有拿到报酬，还要养育这个孩子。