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90年代保送计划实施考试科目多元化
作为一项全国统一考试，在人们的印象中，高考改革似乎始终未能触及“大一统”的格局。而事实上，恢复高考后的30余年间，对统一考试、统一招生方式的改革探索始终没有停止过。
1984年，我国开始保送生的试点，即由中学推荐，高等学校考核同意，免予参加高考，直接进入高校学习。20世纪90年代初，保送生计划人数曾一度扩大。但保送过程中出现了中学为了提高名牌大学的升学率，“推良不推优”的倾向，出现了申报作假、干部和教师子女保送比例过高等现象。1999年教育部规定，全国所有保送生都必须参加综合能力测试。
另一项重要的改革则出现在考试科目变化上。
继1988年上海、浙江先行试点普通高中毕业会考后，1989年7月，原国家教委决定在全国试行高中会考制度，并在会考的基础上改革高考招生制度。
当时，教育部门已经注意到，由于一些地方政府和教育行政部门对考试结果使用不当，高考升学率成为评估学校、教师和学生的唯一依据，片面追求升学率现象突出，一些学生偏科严重，高考客观上承担了对高中教育教学有偏颇导向的责任。
此后，湖南、云南、海南三省于1991年进行了在高中会考基础上减少高考科目的改革;1995年全国各省、自治区、直辖市都实行了会考后的高考“3+2”科目组设置方案，即语、数、英三科为必考科目，文史类加考政、史;理工类加考理、化，每科满分原始分150分。
在“3+2”高考科目改革8年后，1999年广东省率先探索“3+X”高考科目改革方案。语文、数学、外语三门为必考科目，“X”是在政治、历史、地理、物理、化学、生物等科目中选择1-2科。此后，各省陆续实施的“3+X”科目方案是“3+文科综合/理科综合”，少部分省市实施的是“3+大综合(或)+1”方案。
北京市教育考试院副院长臧铁军认为，“3+X”科目改革的实施，在客观上改变了以往全国一张试卷、一种高考模式的状态，多样化的高考模式初露端倪。这一改革对考试内容改革起到了前所未有的推动作用。
21世纪各地自主命题自主招生开始推广
“3+X”的推行使得高考大一统的局面开始松动。
2000年，教育部决定实施分省命题，上海、北京率先单独组织高考命题工作。同年，北京、安徽等省区市试行春季高考改革，一年举行两次高考，试图改变“一考定终身”的格局。但改革带来的新问题也接踵而至。实行春季高考后，由于参与招生的学校和专业都不理想，以致考生积极性不高。在2004年