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复旦大学创建于1905年，原名复旦公学，是中国人自主创办的第一所高等院校，创始人为中国近代知名教育家马相伯。校名“复旦”二字选自《尚书大传•虞夏传》中“日月光华，旦复旦兮”的名句，意在自强不息，寄托当时中国知识分子自主办学、教育强国的希望。1917年复旦公学改名为私立复旦大学；1937年抗战爆发后，学校内迁重庆北碚，并于1941年改为“国立”；1946年迁回上海江湾原址；1952年全国高等学校院系调整后，复旦大学成为文理科综合大学；1959年成为全国重点大学。
上海医科大学创建于1927年，是中国人自主创办的第一所高等医学院校。建院时定名为第四中山大学医学院，1932年改名为国立上海医学院，1952年更名为上海第一医学院，1959年成为全国重点大学，1985年改名为上海医科大学。
2000年，复旦大学与上海医科大学合并，成立新的复旦大学，进一步拓宽了学校的学科结构，办学实力进一步增强，已经发展成为一所拥有哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、医学、管理学、艺术学等11个学科门类的综合性研究型大学。
最新或2022（历届）年，学校有普通本专科生12933人，研究生16026人，留学生3216人（其中攻读学位的留学生2092人）；另有成人教育、网络教育本专科生13259人。有专任教师2490人，其中高级职称1771人。有中国科学院、中国工程院院士40人，其中双聘院士12人，教育部“长江学者奖励计划”特聘教授58人、讲座教授34人，“国家重点基础研究发展计划（含重大科学研究计划）”项目首席科学家29人。有直属院（系）30个，设有本科专业69个，一级学科博士学位授权点35个，博士学位授权学科、专业点154个（其中自设30个，专业学位2个），硕士学位授权学科、专业点243个（其中自设51个，专业学位24个），并设有29个博士后科研流动站。有11个一级学科国家重点学科、19个二级学科国家重点学科，10个上海高校一流学科（A类）。有国家重点实验室5个，教育部工程研究中心4个，教育部重点实验室12个，卫生部重点实验室9个，总后卫生部重点实验室1个，上海市重点实验室10个。学校还拥有中山医院、华山医院等6家直属附属医院和一批非直属附属医院。
学校已经形成“一体两翼”的校园格局：即以邯郸校区、江湾新校区为一体，以枫林校区、张江校区为两翼。占地面积244.32万平方米，校舍建筑面积149.23万平方米。
一百多年来，学校在人才培养、科学研究、服务社会、文明传承与创新等方面为国家作出了突出贡献。复旦师生谨记“博学而笃志，切问而近思”的校训，严守“文明、健康、团结、奋发”的校风，力行“刻苦、严谨、求实、创新”的学风，发场“爱国奉献、学术独立、海纳百川、追求卓越”的复旦精神，正按照党和国家的要求，发扬优良传统，不断开拓创新，以服务国家为己任，以培养人才为根本，以改革开放为动力，深入推进内涵建设，全面提高教育质量，加快建设具有中国特色的世界一流大学，为实现中华民族伟大复兴的中国梦作出新的更大的贡献。