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问题，例如企业在购买自来水、电、蒸汽等能源的同时，已经支付了排污费、资源使用费和环境治理费。但是，企业自建污水处理系统达标排放的情况下，不但仍需按排放流量重复缴纳排污费，而且还需按允许排放COD额度缴纳排污权费(后续还可能增加二氧化硫、氮氧化物、氨氮等的排放额度缴费，以及碳排放费等)。此类重复收费我们认为不合理，建议相关部门对环保收费项目的依据进行重新评估，清理重复的收费项目。
此外，对企业自建污水处理系统的运行、排放情况进行监控是环保管理部门的职责，但环保管理部门却采取由企业出高价钱，请环保管理部门指定的机构安装、维护在线监控设备来实现监控，加大了企业负担。
二、对环保收费用途进行公示，确保专款专用
企业缴纳了种类繁多的环保费用，但企业和社会对这些费用的用途、去处并不知情，感觉不到运用这些经费进行环保治理的具体措施，亦未看到环境治理的成果，完全丧失了对环保费用使用的知情权和监督权。比如噪声费，环保部门收取后并未见实施任何降噪措施，成了名符其实的“空费”。因此，建议对环保收费的用途进行公示，不但要对项目实施的时间、地区公开，还要对项目实施效果进行公示，便于公众监督。
三、综合考虑经济发展的实际需要，优化排放考核指标
各地要发展经济，经济总量增加，碳排放、COD排放总量也会相应的增加，老百姓生活水平提高亦会增加碳排放量。目前要求各省一刀切控制碳排放和COD排放总量并逐年降低一定百分比，而且实行一票否决制，我认为当前情况下采取总量控制不合理，将会制约实体经济的发展、影响居民生活水平的提高，建议改为按不同行业产品的单位产量的排放逐年降低的方法来考核，从单位能耗为国家做出实际贡献的角度出发，这样一方面充分鼓励企业通过技术改造主动节能减排降低单位能耗，另一方面也不至于影响经济发展，影响百姓生活。
四、认真投入污染源研究，提高环境治理效率
因为缺少对污染源的长期、深入研究，导致当前环境质量恶劣的原因、各种因素的权重等并不清楚，使得环境治理效率低下。
比如说煤炭燃烧污染问题。我国是煤炭资源大国，煤炭是最经济、便捷的能源种类之一，但鉴于环保管理要求限制了煤炭的使用，代之以高价进口的石油、天然气等，导致煤矿大量关闭、工人失业。需要投入研究目前的环境问题有多少是因为燃煤引起的；采用先进技术对烟气进行脱硫脱硝等深度处理后，燃煤污染又可以减少到多少等，才能充分科学评估配备烟气深度处理系统的燃煤污染风险。事