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1998年年近41岁的姚木根调任江西省人民政府办公厅副主任、党组成员。是时，郑克强担任江西省政府副秘书长。刚从计委调到政府办公厅工作的姚木根由于没有办公地方，就在郑克强的办公室加了一张办公桌。郑克强的印象中，姚木根是一个极聪明的人，但聪明反被聪明误。
郑克强说，姚木根抽烟、喝酒，酒量很大，“一斤多没问题”，文章也写得不错。
一位知情人士称，姚木根经济科班出身，写文章很厉害，他发表的文章和讲话都是自己写的，都不怎么用秘书写。
之后，姚木根擢升江西省人民政府副秘书长、办公厅主任、江西发改委主任，最后至江西省副省长。
直至最新或2022（历届）年3月22日，中纪委宣布其涉嫌严重违纪违法，目前正在接受组织调查。至于严重违纪违法的具体内容，中纪委尚未公布。
在姚木根被调查后，有消息称，之前一直因矿产开发被村民举报的其二弟也传被调查。不过3月26日，21世纪经济报道记者从其任职县的县政府办公室了解到，其二弟仍在正常上班。
江西落马官员
两会后首位落马副部级官员
姚木根是“两会”结束后，中央纪委宣布接受调查的首位副部级官员。“两会”结束至今，中央纪委网站已经通报了16位官员被调查的信息，平均每天2名。甚至在两会期间，中纪委也通报了9名官员，几乎一天一名，其中还包括两名省部级官员，云南省副省长沈培平就在两会期间落马。
姚木根也是目前为止江西省被调查的第二位副部级官员。此前，在最新或2022（历届）年12月6日，江西省人大常委会副主任、省总工会主席陈安众因同样原因被宣布调查。不过，两人交集不多，姚木根2007年3月至2011年8月一直担任江西省党组书记，而陈安众在2010年3月才成为党组成员。
刊登其署名文章的电子版被撤
昨天的《江西日报》在2版右侧，刊登了江西省副省长姚木根《加强河湖管理推进水生态文明建设》的署名文章。昨天是世界水日，姚木根的署名文章为此而写，副题即为第二十二届“世界水日”、第二十七届“中国水周”。但在中纪委宣布姚木根被查的消息后，作为江西省省委机关报的《江西日报》2版电子版被撤下。不过，在电子版右侧的大江网即时新闻排行榜中，姚木根被调查的消息排行第二。
姚木根在文章中称：“要尊重自然规律和经济社会发展规律，以水定需、量水而行、因水制宜，推动经济社会发展与水资源和水环境承载力相协调。建立体现生态文明要求的目标体系、考核办法、奖惩机制，把水资源管理和责任考核结果作为地方政府领导综合评价和行政区项目审批的重要依据。”
水资源管理正是姚木根所分管的领域。根据江西省政府最新或2022（历届）年7月31日发布的有关省政府领导分工的官方文件，姚木根是排名第五的副省长，分管国土资源、农业、粮食、人口和计划生育、人防方面的工作，具体分管15个部门的工作，同时联系省军区、省武警总队、江西储备物资管理局、中储粮江西分公司、省气象局等5个部门。