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主任：鲍红
副主任：王康友 李志刚 李晓亮（兼）
职能简介：负责组织协调、处理中国科协机关日常工作事务和有关重要决定事项的督办；负责公文处理、秘书、机要、保密、文书、档案管理、来信来访、信息等工作；负责中国科协重大活动和重要会议的组织协调。
计划财务部
部长：彭友东
副部长：任林 公坤后
职能简介：负责拟定中国科协工作规划、年度计划和科协事业发展规划及基本建设计划；负责布置编制下达年度经费预算计划；负责中国科协机关各部门、事业单位、有关学会等年度财务决算审核批复工作；负责与国家经济、计划、财政等部门的对口业务联系工作；负责组织贯彻执行国家的财经法规，对中国科协有关经济、财务、资产管理、审计等工作进行监督管理；负责科协系统综合业务统计。
组织人事部
部长：李森
副部长：王守东 王慧梅
职能简介：指导科协系统组织建设工作；维护科技工作者合法权益；组织表彰科技工作者；负责综合、协调科技工作者之家规划建设工作；按照中央人才协调小组的要求，统筹协调科协系统人才工作。按照干部管理权限，负责中国科协机关和直属单位的干部人事管理工作，规划、协调和指导科协系统专职干部的教育培训工作。
中国科学技术协会新闻发布会现场调研宣传部
部长：王春法
巡视员兼副部长：崔建平
职能简介：制定中国科协宣传工作规划，承担中国科协与党和国家宣传主管部门的联系工作，指导全国学会和地方科协的宣传工作；负责有关重要文件、报告和讲话的起草；开展面向科技工作者状况的调查研究，指导全国学会和地方科协有关科技工作者状况的调查研究工作；组织开展决策咨询和建言献策活动；参与国家有关法律法规的立法调研以及修订工作；完成科协书记处交办的有关工作。
学会学术部
部长：沈爱民
副部长：杨文志 朱雪芬
职能简介：按照《社会团体登记管理条例》，负责对中国科协所主管的全国性学会、科技类社会团体进行监督管理；负责综合性重点学术交流的组织协调工作，指导有关学会的学术活动；负责有关学会学术类期刊的业务指导和管理工作；负责有关学会继续教育工作的组织和管理。
科协以普及科技为己任科学技术普及部
部长：王可
副部长：高勘 殷皓
内设机构：基层处、基础处、资源处、综合处。
职能简介：科学技术普及部是中国科协书记处领导下负责科学技术普及工作和推动实施《全民科学素质行动计划纲要》（以下简称《全民科学素质纲要》）的职能部门。按照《中华人民共和国科学技术普及法》、《全民科学素质纲要》和国家有关科普工作的方针、政策，负责组织开展群众性、社会性、经常性的科普活动；支持有关社会组织和企事业单位开展科普活动；协助政府有关部门制定科普工作规划，为政府科普工作决策提供建议；负责拟定科协系统科普工作规划和年度计划，并组织实施；研究、总结、推广面向社会开展科普工作的经验；指导科协系统科技馆等科普设施、科普队伍的规划、建设与管理工作；负责有关学会科普类期刊的业务指导工作；承担中国科协常委会科学技术普及专门委员会、促进农村和少数民族地区发展专门委员会及中国科协妇女儿童工作联席会议的办公室工作。