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编导第三个重要的质疑针对93号航班。好莱坞后来还拍摄了一部电影，名字就叫《93号航班》，很感人。但是纪录片编导指出，这是一个伪造的故事。美国官方指出，93号原计划撞向白宫，后坠毁于宾夕法尼亚。然而，第一时间赶到现场的记者发现，坠毁现场只有一个5-7米长，宽约3米多的坑。赶到现场的验尸官说，没有任何乘客的尸体。纪录片编导认为，93号航班的坠毁是伪造的。真实情况是，93号航班大约在10点45分左右，降落于俄亥俄州霍普金斯机场，官方说93号航班上有200名乘客，纪录片编导认为只有少数几个特工。 2003年5月10日，航空公司的一名工作人员，在芝加哥O’Hare机场发现，美联1111航班的尾部有一个编号：N591UA。普通人可能不明白这个编号的含义，专业人员知道，这个编号原先属于93号航班！而这两个航班的机型都是757。
如果要质疑93号航班的坠毁，如何解释飞机上乘务员、乘客与地面的通话呢？纪录片编导播放了911委员会提供的电话录音，一名女乘务员在向地面报告有3人死亡，自己也不能呼吸的时候，声音镇定、平缓，没有任何紧张或气喘，声音背景干干净净，没有任何杂音。一个乘客给母亲打电话时，报的是自己的英文全名！有 “好事者”做了这样的试验：在航班正常飞行的高度，手机与地面电话的接通率是0.6%。911事件3年后，2004年，美航为了让乘客在飞机上也能正常使用手机，特地在飞机上安装了一个信号基站。而911的时候，飞机上没有这个东西。93号航班上给妈妈打电话的那位乘客，通了断了好几次，按照没有基站时 0.6%的接通率，几乎不可能。编导认为，电话录音是伪造的。
美国官方对于几架飞机黑匣子的说法是，有的没有找到，有的找到了，但数据已经被破坏，无法恢复，因此不能从黑匣子里得知当时飞机上的情况。纪录片编导指出，在世贸大楼坍塌的废墟里，官方居然找到了一个劫机恐怖分子的护照！护照能够完好无损，黑匣子居然被破坏，可能性也许有，但真的很小很小。同时，有目击者说，在世贸废墟里，确实找到了黑匣子。人们相信谁呢？
纪录片编导还指出一系列的质疑，例如：美国政府宣布共有19名劫机者名单。既然飞机撞毁，劫机者应该都死了。但是，到纪录片摄制完成的时候，各国媒体发现，19名劫机犯中，至少还有9人活着，安全地生活在世界各个地方；美国政府认定本拉登策划了911事件，证据是本拉登的一盘录像带。编导指出，本拉登是左撇子，但是在那个录像中，本拉登用右手写字，而且还戴着金戒指。
除本纪录片之外，美国以及欧洲其他国家，对911事件的真实性提出质疑的人有很多，但是，这个纪录片是我所见到最全面的质疑。总而言之，该纪录片编导认为，911事件是一个美国政府自编自导自演的苦肉计。为什么？编导提供了几个现象，让观众自己寻找答案：世贸大楼租用者在911事件前1个半月，购买了35亿美元的保险，赔付条件中包含了“恐怖主义”，事后获得70多亿的赔偿；世贸大楼地下共存有价值约1670亿美元的黄金，911事件后，只找到了大约2亿！7号楼内大量美国国家安全的资料，华尔街的交易资料被销毁；……如果这个纪录片所说的是真的……