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话说，这孙悟空取完了经当了个斗战胜佛本可以在峨眉山享受天伦之乐了，可事情往往没有这么简单。
这天，柯南边走边唱，忽然灰原打电话过来说：“柯南，我发明了一种药可以让你重新变回工藤新一。”柯南听后，滑着滑板火速赶往灰原家。
到了灰原家，柯南就吃下了药重新变回了帅气的工藤新一了。工藤新一对灰原说：“谢谢你灰原。”灰原不做声，惭愧的说：“我的能力有限，这种药只能维持一天，而且制作一颗的材料也很难找，所以你就好好利用这一天的时间去做你该做的事。”工藤新一任面带微笑地说：“一天已经很不错了，我在一次谢谢你。”就在这时他接到了一通电话，电话里说：“又有好多人变成了小孩那些秘密组织又在作案了。”
工藤新一听了马上赶到了现场，见到那么多跟自己一样的遭遇，决心要把这个组织给打散、打破，于是他单枪匹马的来到那里，俗话说得好“人多力量大”工藤新一，一局已遍体鳞伤，但他仍在和组织里的人作战，他在别人不注意的时候，他拨通了孙悟空的电话。让他来帮忙。
孙悟空本来正在吃着香蕉喝着酒，听到后马上使用瞬间转移来到了那里，孙悟空又使用乾坤大挪移把这些人送到侏罗纪，让他们去享受享受被恐龙围攻的滋味。
孙悟空又从太上老君的炼丹炉里拿了好几瓶仙药给这些被变成小孩的人们吃柯南也变成了真正的工藤新一。
小兰见到工藤新一就像故友重逢一样的抱在了一起。
孙悟空看了满意地笑了，又回到峨眉山当他的斗战胜佛了。